Lähes kaikki Ecuadorin joet ovat peräisin vuorilta. Tämän maan sadekauden aikana tammikuusta huhtikuuhun monet joet täyttävät pankkinsa.
Guaitara -joki (Rio Carchi)
Guaitara on yksi Etelä -Amerikan jokista, jotka virtaavat Kolumbian ja Ecuadorin alueiden läpi. Kanavan kokonaispituus on 158 kilometriä. Joen lähde sijaitsee Kolumbian Chiles -tulivuoren rinteillä (korkeus 4753 metriä merenpinnan yläpuolella). Tämä joki antoi nimen yhdelle Ecuadorin maakunnista - Carchi.
Guyas -joki
Guyas -joen pohja on kokonaan Ecuadorin alueella. Sen pituus on 389 kilometriä. Joen lähde on Chimborazo -tulivuoren juurella, ja Guyas -polku päättyy Guayaquil -lahden vesiin.
Joen rannalla on yksi Ecuadorin suurimmista kaupungeista - Guayaquil ja hieman pienempi Duran. Joenlaakso sijaitsee Andien juurella, jotka erottavat sen Tyynenmeren rannikolta.
Kurarai -joki
Curarai on Etelä -Amerikan joki, joka on osa valtavaa Amazonin allasta. Virtauksen kokonaispituus on 800 kilometriä, josta 414 kilometriä kulkee Perun maiden läpi. Kurarai on Napo -joen sivujoki (oikealla).
Joen lähde sijaitsee Andien itäisellä juurella. Tämän jälkeen Kurarai kulkee kahden provinssin maiden läpi: Pastasa (Ecuador); Loreto (Perun alue).
Joenpohja kulkee harvaan asutun selvan maiden läpi. Joen laaksossa asuu pääasiassa Quechua ja Waorani - alkuperäiskansojen intiaaniheimoja. Joki on täynnä virtausta ympäri vuoden, mutta se on purjehduskelpoinen vain alajuoksulla.
Pastasa -joki
Joki kulkee Ecuadorin ja Perun alueen läpi. Virran kokonaispituus on 710 kilometriä. Pastasa on yksi Marañon -joen suurimmista sivujoista.
Joen lähde on Cotopaxin maakunnassa (Ecuador, Cotopaxin tulivuori). Sen yläosassa sitä kutsutaan Patateksi, ja vasta sen jälkeen, kun se on saanut Chambo -joen vedet, sitä aletaan kutsua Pastasaksi. Joella on melko vähän sivujokia. Ja merkittävimmät pastat ovat: Chambo; Wasaga; Bobonas.
Putumayo -joki
Joki kulkee useiden osavaltioiden - Brasilian, Kolumbian, Perun ja Ecuadorin - alueiden läpi. Suurin osa 1800 kilometrin jokivirrasta kulkee Brasilian alueiden läpi ja vain yläjuoksulla se kulkee osittain Ecuadorin läpi.
Putumayolla on useita suuria sivujokia, ja se itse virtaa Amazonin vesiin (sen vasemman sivujoen). Korkein joki on lokakuusta toukokuuhun.