Portugalin joet muodostavat melko tiheän verkoston. Suuret joet, kuten Duero, Tajo ja Guadiana, kulkevat Portugalin alueen läpi. Maan jokille on ominaista vedenpinnan nousu talvella ja syksyllä sekä laskeminen kesällä.
Tejo -joki (Tahoe)
Tajo on yksi koko Pyreneiden niemimaan suurimmista jokista, joka kulkee kahden maan - Espanjan ja Portugalin - alueen läpi. Joen lähde on Espanjassa, mutta nyt Tajo päättyy Lissabonin (Portugali) maihin ja virtaa Atlantin vesille.
Virran kokonaispituus on 1038 kilometriä. Samaan aikaan 716 kilometriä kulkee espanjalaisten maiden läpi. Sitten 47 kilometriä virtaa on luonnollinen raja ja loput 275 kilometriä kulkevat Portugalin alueen läpi.
Portugalin alueella joen nimi on Tejo, Espanjassa - Tejo. Yhdistymispaikka on Mar da Paglia -lahden vedet, joita luullaan Tajoksen suistoksi.
Sadu -joki
Sadu on yksi maan tärkeimmistä jokista. Joen lähde on Serra de Caldeiran -vuorten rinteillä. Joen kokonaispituus on 180 kilometriä. Sado ylittää maan etelästä pohjoiseen ja täydentää matkan yhdistämällä Atlantin valtameren vesille (lähellä Setubalin kaupunkia). Joki kulkee useiden kuntien alueiden läpi: Orique; Santiago do Cacén; Grandola; Ferreira do Alentejo; Alcacer do Sal.
Joella on useita patoja, ja näiden säiliöiden varantoja käytetään riisi- ja maissipeltojen kasteluun. Vihanneksia ja hedelmiä kasvatetaan myös joen rannalla. Hyvin harvinainen delfiinilaji asuu joen suulla, jota esiintyy vain näissä paikoissa.
Zezere -joki
Zezere on joki, joka kulkee Portugalin alueen läpi. Joen lähde on Serra da Estrela -vuorilla (korkeus 1900 metriä merenpinnan yläpuolella) lähellä Cantaro Magroa.
Virran kokonaispituus on 242 kilometriä. Joki päättää tien ja yhdistää Tajoksen vesiin. Vesistöalue on 5043 neliökilometriä. Zezerellä on useita sivujoita, ja itse vesistöön on rakennettu kolme vesivoimalaitosta (ne tuottavat 700 miljoonaa kilowattituntia vuodessa).
Mondego -joki
Mondego -joki kulkee vain Portugalin läpi ja sen kokonaispituus on 234 kilometriä. Joen lähde on Serra da Estrela -vuorten rinteillä, ja yhtymäkohta on Atlantin vedet (Figueira da Fozin alue).
Mondego on suurin joki, joka kulkee Portugalin alueiden läpi. Suurin kaupunki sen rannalla on Coimbra.
Tamega -joki
Tamega on Douro -joen sivujoki ja kulkee Espanjan ja Portugalin alueiden läpi. Virran kokonaispituus on 145 kilometriä. Tamegan lähde sijaitsee espanjalaisilla mailla (Galician alueella), minkä jälkeen se "menee" Portugaliin.
Patot tukkivat joen useissa paikoissa, joten se ei sovellu navigointiin suurimmalla osalla kurssia.
