Suurin osa Hondurasin jokista on vuoristoisia. Ja koko tasavallan suurimpien jokien luettelo avataan - Patuka, Ulua ja Aguan.
Aguan -joki
Joki kulkee Pohjois -Hondurasin alueiden läpi Yoron departementista alkaen. Sitten hän lähtee matkalle valitsemalla itäsuunta ja ylittämällä Colonin departementin maat. Ja matka päättyy virtaamalla Karibianmeren vesiin (lähellä Santa Rosa de Aguánia). Virran kokonaispituus saavuttaa lähes neljäsataa kilometriä. Aguanalla on useita sivujoita.
Joenlaaksoa käytetään aktiivisesti maataloudessa. Virran ylä- / keskiosassa olevassa laaksossa on vihanneskenttiä sekä maissi- ja papuviljelmiä. Alemman joen laakso on riisin ja sitrushedelmien vallassa. Täällä kasvatetaan myös öljypalmuja ja sycamoreja.
Riu-Sumpul-joki
Rio Sumpul tekee tiensä kahden osavaltion - El Salvadorin (sen luoteisosa) ja Hondurasin (lounaisalueet) - maiden läpi. Joki on hyvin lyhyt - vain seitsemänkymmentäseitsemän kilometriä - ja se on koko pituudeltaan raja, joka jakaa näiden valtioiden alueet.
Rio Simpulin lähde sijaitsee El Salvadorissa. Siellä joki ylittää useita kuntia (kaikki sijaitsevat yhdessä departementissa - Chalatenangossa). Se virtaa Rio Lempan vesiin.
Rio Torola -joki
Rio Torola kulkee Keski -Amerikan läpi virtaamalla El Salvadorin (koillis) ja Hondurasin (tasavallan eteläosa) halki. Rio Torolan kokonaiskesto on hieman yli sata kilometriä. Joki saa alkunsa Salvadorin alueelta paikassa, jossa Lahitas -joki sulautuu Mansukupagua -puroon. Rio Torolan suu on Rio Lempan vesi.
Ulua -joki
Joenpohja leikkaa Hondurasin alueen pohjoisosassaan alkaen Intibucan departementin maista (lähellä La Pazia, Cordillera de Mentesillos -vuorten rinteitä). Virtauksen kokonaispituus on 358 kilometriä, ja sen valuma-alue on lähes kaksikymmentä kolme tuhatta neliötä.
Joki muodostuu Sasagua- ja Puringla -jokien yhtymäkohdasta. Ylävirralla se tunnetaan nimellä Rio Grande de Otoro. Aluksi joki juoksee pohjoiseen ylittäen Santa Barbaran kauttakulun aikana, mutta sen jälkeen Ulua kääntyy jyrkästi länteen ja ohittaa kolme osastoa - Yoro, Cortes ja Atlantis - suorittaa polun Hondurasinlahden vesillä.
Goaskoran -joki
Goaskoran räjäyttää polun Hondurasin ja El Salvadorin alueiden läpi ja ylittää eteläisen maan. Virtauksen pituus on noin sata kolmekymmentä kilometriä ja sen valuma-alue on kaksituhatta kuusisataa kuusikymmentä kolme neliökilometriä.
Virtauksen viimeiset kahdeksantoista kilometriä on kahden valtion välinen luonnollinen raja. Goaskoran -vesi on juomaveden lähde rannalla asuville maan asukkaille.
