Kaikki Kuuban joet ovat lyhyitä ja hyvin niukkoja. Lisäksi suurin osa siitä virtaa Karibianmeren vesille.
Almandares -joki
Maantieteellisesti joenpohja sijaitsee saaren länsiosassa ja sen kokonaispituus on 47 kilometriä. Joen lähde on Sequito -järvi, joka sijaitsee 225 metrin korkeudessa merenpinnan yläpuolella. Sitten Almandares ylittää maan luoteissuunnassa ja virtaa Floridan salmen vesille (lähellä Havannaa).
Joen vedet ovat erittäin voimakkaasti saastuneita. Tätä helpottavat lukuisat yritykset - panimot, rakennuslaitokset, kaasuvarastot ja paperitehtaat.
Almandarem Park (pääkaupungin puisto) sijaitsee joen rannalla.
Kauto -joki
Cauto kulkee Santiago de Cuban ja Granman maakuntien halki. Lisäksi se on saaren pisin joki - joen pohjan kokonaispituus on 343 kilometriä.
Kauton lähde on saaren kaakkoisosa, Sierra Maestra -vuoret. Sen jälkeen joki ylittää maan luoteissuunnassa ja päättyy Guacanayabo Bayn vesille (lähellä Manzanillon kaupunkia).
Joki on purjehduskelpoinen vain alakurssilla - viimeiset 110 kilometriä ennen yhtymäkohtaa. Joki on erittäin saastunut, eikä sitä voida käyttää juomaveden lähteenä.
