Perun joet kuuluvat suurimmaksi osaksi maailman suurimman joen - Amazonin - altaaseen.
Javari -joki
Zhavari on yksi Etelä -Amerikan keskiosassa sijaitsevista joista. Maantieteellisesti joenpohja kuuluu kahteen maahan - Peruun ja Brasiliaan. Kanavan kokonaispituus on 1056 kilometriä. Javari kulkee Brasilian luoteisosan läpi ja on Amazonin oikea sivujoki.
Joen lähde on Perun Andien (La Montagna) rinteillä. Sitten se laskeutuu vuorilta ja loput virtauksesta on Brasilian ja Perun välinen luonnollinen raja.
Joki on purjehduskelpoinen 500 kilometriä suusta ylöspäin. Sadekaudella, joka kestää tammikuusta toukokuuhun, navigointikelpoisen osan pituus kasvaa.
Girua -joki
Girouis on yksi monista Amazonin oikeista sivujoista. Joen kokonaispituus on 3280 kilometriä. Lähde on La Montian kaupunki (Peru), joka sijaitsee Perun Andien juurella.
Joki on purjehduskelpoinen 1823 kilometriä yhtymäkohdastaan (Cruzeiro do Sulin kunnan alueelle). Vesistöalue on asuttu, mutta pääasiassa joen keskellä.
Kurarai -joki
Curarai on yksi Etelä -Amerikan jokista, joka sijaitsee kahden maan - Ecuadorin ja Perun - alueella. Se on Napo -joen oikea sivujoki. Joen lähde on Andien itäiset juuret.
Kanavan kokonaispituus on 800 kilometriä. Ja se kulkee Pastan (Ecuadorin maakunta) ja Loreton (Perun alue) alueen läpi. Perun alue on 414 kilometriä pitkä. Kurarai on syvä ympäri vuoden, mutta se on purjehduskelpoinen vain alajuoksulla. Joenpohja kulkee harvaan asuttujen alueiden läpi. Pääasiassa intialaiset - Waorani ja Quechua - asuvat joen rannalla.
Madre de Dios -joki
Madre de Dios kulkee kahden maan - Perun ja Bolivian - alueen läpi ja kuuluu Amazonin altaaseen. Joen pohjan kokonaispituus on 640 kilometriä.
Joen lähde on Perun Andeissa.
Madre de Dios on yksi tärkeimmistä vesiväylistä Amazonin yläosassa. Joen rannalla on suuri satamakaupunki - Puerto Maldonado. Hänen jälkeensä joki on purjehduskelpoinen.
Joenlaaksoa käytetään aktiivisesti mangojen kasvattamiseen. Lisäksi täällä louhitaan kultaa sekä hakataan teollisesti. Joen rannalla on useita suojeltuja luontoalueita.
Mantaro -joki
Joen pohja on kokonaan Perussa ja sen pituus on 724 kilometriä. Mantaro on Apurimaca -joen haara. Maantieteellisesti kulkee seuraavien maakuntien maiden läpi: Junin; Yauli; Hauka; Concepcion; Huancayo.